父母都是 AA，近親幾代後會跑出B來？

taiwanp · 發表於 2010-12-22 18:47:50

假設，公豬與母豬都是 AA ，但是，一直使用近親交配，到第幾代容易跑出 B 出來？？

還是，只是父母都是 AA ，就不會跑出 B 來呢？？

蘇少儀 · 發表於 2010-12-22 21:21:21

除非
Aa驗成AA否則即便近親亦不致出現(國中生物課本有教)
不知道林老師是否同意.................

[ 本帖最後由蘇少儀於 2010-12-22 21:22 編輯 ]

Bananafish · 發表於 2010-12-22 21:30:53

不會有這種事情發生...........

pighead · 發表於 2010-12-22 22:26:42

國中與高中的生物都如此說：
父畜AA x 母畜AA ---> 後裔AA
因為

母畜卵子父畜精子	A	A
A	AA	AA
A	AA	AA

假設緊迫基因的A基因與B基因之間只差異一個DNA鹼基，而一般科學界認為一個鹼基的突變機率
為十萬分之一，那麼父方與母方只要有一方出現該鹼基的突變就會造成子代具有變成AB的機會，
所以應該是五萬次近親交配當中該鹼基會有一次突變出現，不過，可能在出現突變之前近親衰退
所造成的繁殖障礙或是免疫問題就已經讓這個近親系無法繁衍了，哈哈哈，我這是在做甚麼？
廢話了167個字！抱歉，今天一早就出差去，晚上才回到台北，趁機去逛了電腦商品店，頭腦有點
問題！

[ 本帖最後由 pighead 於 2010-12-22 22:34 編輯 ]

蘇少儀 · 發表於 2010-12-23 08:09:24

林老師，我是因為好奇，對上述問題衍生出更多問題
有的蛋白質的表現會受到鹼基的突變而改變
緊迫基因是單一基因或多基因調控，鹼基改變就會造成顯性變隱性嗎？

Malignant hyperthermia (MH) causes neurological, liver, and kidney damage and death in humans and major economic losses in the swine industry. A single point mutation in the porcine gene for the skeletal muscle ryanodine receptor (ryr1) was found to be correlated with MH in five major breeds of lean, heavily muscled swine. Haplotyping suggests that the mutation in all five breeds has a common origin. Assuming that this is the causal mutation for MH, the development of a noninvasive diagnostic test will provide the basis for elimination of the MH gene or its controlled inclusion in swine breeding programs.
Fujii J; Otsu K; Zorzato F; de Leon S; Khanna VK; Weiler JE; O'Brien PJ; MacLennan DH
Science;253(5018):448-51, 1991 Jul 26.

The substitutions of T for C1843 in the porcine ryanodine receptor (RYR1) gene, which deletes a HinPI restriction endonuclease site and creates a HgiAI site, and of T for C1840 in human RYR1, which deletes a RsaI site, lead to Cys for Arg substitutions in the ryanodine receptors and are probable causal mutations for malignant hyperthermia (MH). To improve the restriction endonuclease assay of these sites, thereby providing an accurate, reliable diagnosis for MH, introns flanking the exon containing the mutation were sequenced, permitting identification and PCR amplification of a 659-bp porcine gene sequence that contains both constant and variant HgiAI sites and a 922-bp human gene sequence that contains both constant and variant RsaI sites. As a result, these PCR-amplified sequences contain constant internal controls for the reliable differentiation by restriction endonuclease digestion of normal, heterozygous, and MH genotypes.
Genomics. 1992 Jul;13(3):835-7.

林老師的假設（論點）是對的
the skeletal muscle ryanodine receptor (ryr1)基因的單點突變就會造成
而機率上來說那也是微微乎其微微

對了這是問問題必須付款的（希望林老師沒看到這一句話.............）

[ 本帖最後由蘇少儀於 2010-12-23 08:41 編輯 ]

pighead · 發表於 2010-12-23 13:55:27

我看到了！(年關將近啦，老花眼突然變清晰)

緊迫基因(Stress gene)又稱為鹵乙烷(Halothane gene)，正式的學術名稱就是ryanodine receptor (RYR1) gene，位於豬隻第六號染色體上。
在豬隻的這個基因上的確就是一個DNA鹼基變異(T --> C)造成後續產生的蛋白質序列上的胺基酸從
Cysteine 變成 Arginine，結果也造成這個ryanodine receptor的立體結構形狀改變，使得這個肌肉
細胞表面受體的功效不完整，所以細胞通透性也改變(這種變異就稱為non-synonymous single
nucleotide polymorphism, nsSNP)，所以這是一個單一基因調控的現象。
如果第六號染色體對稱的一對兩條上都是這個變異(就是一般稱之為BB者)，就會造成所有肌肉細胞
上的ryanodine receptor結構都改變了，自然其表現就非常明顯。可是對一個雜合子 (heterzygous)
個體(所謂的AB者)的肌肉細胞上正常與改變的ryanodine receptor都存在，其正常功能大致上還是可
以維持的，所以從表現型上來判定，就稱B基因為隱性，A基因為顯性，因為在AB個體生理中，只
要A存在就可以顯出A的效用而掩蓋大部分B所產生的影響。

既然學理上已經很清楚了(1990年左右就在人類與動物中發現的)，我為什麼用假設這個字眼？
因為機率很小的突變而造成這樣劇烈影響的位置點可能不只一個，其他鹼基突變也可能產生類似的
效果，雖然機率也是一樣小，可是在學術與統計上都不能就說只有這個位點是唯一的位點。

上述的單點突變假設如果拿到另一個基因(雙倍肌肉基因double muscle gene，正式的學術名稱為
Myostatin gene)在肉牛上就正好有兩個不同突變點都會造成類似的效果，只是兩個突變點各自在
不同的牛隻品種上出現，不過若來個育種者將這兩種肉牛配種就會與前述單點突變假設不同的條件
囉！

蘇少儀 · 發表於 2010-12-23 17:47:18

林老師您是期末考將近，林老師需要保持清醒
或是見$$$眼開啊！！！
即然這樣，明日捐NT$300給網站........................

而這個基因突變發生的機率應該較1/100,000更微乎其微
因為這個基因座（locus）是一個600多個鹼基序列
這個位點基因會改變酵素的構型，所以一突變，酵素就沒用了
但在算機率時仍然要列計
所以如果檢測無誤（NN/Nn/nn三種等位基因（allele）中的一種），即便以近親育種，在自然界應該不致於發生才是

[ 本帖最後由蘇少儀於 2010-12-23 18:00 編輯 ]

pighead · 發表於 2010-12-23 18:13:06

NCBI Gene database
Sus scrofa ryanodine receptor 1 (skeletal) (RYR1), mRNA
LOCUS NM_001001534 15378 bp mRNA linear MAM 13-DEC-2010
DEFINITION Sus scrofa ryanodine receptor 1 (skeletal) (RYR1), mRNA.
CDS(coding sequence) 130..15237

突變機率 >= 1/100,000

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/396718

蘇少儀 · 發表於 2010-12-23 18:28:09

所以point mutation的機會就是1/100,000的機率
瞭解．謝謝！！！
不過，回歸實務面
1/100,000的意涵是
一對NN（AA）的公母豬的100,000頭後裔中會有一頭
或一對NN（AA）的公母豬的100,000胎後裔中會有一頭
或一頭NN（AA）的公（母）豬的後裔中每100,000頭會有一頭
或臺灣NN（AA）的公母豬所生的100,000胎後裔中會有一頭
或臺灣NN（AA）的公母豬所生的100,000頭後裔中會有一頭
或.......................................
問題還真多

[ 本帖最後由蘇少儀於 2010-12-23 20:05 編輯 ]

信菖牧場 · 發表於 2010-12-23 21:42:20

原帖由 taiwanp 於 2010-12-22 18:47 發表
假設，公豬與母豬都是 AA ，但是，一直使用近親交配，到第幾代容易跑出 B 出來？？

還是，只是父母都是 AA ，就不會跑出 B 來呢？？

所謂的近親....何等級？可提供一下...
但以小弟個人的實際操作...應該是不會的！

杜洛克種豬登錄資料查詢結果

182647 彤羽子代數 0 頭，公母孫代數 0 頭，公母曾孫代數 0 頭，公母	169938 太佐	167165 太保	144151國強
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		163995 媚芳	152537詩傑
			160629玉媚
	175753 彤心	169938 太佐	167165太保
			163995媚芳
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