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場內高效遺傳改良計畫與聯合育種

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發表於 2011-12-23 14:23:20 | 顯示全部樓層 |閱讀模式
        最近十年,豬的生產水準提高很快
        養殖各個環節技術的發展都發揮了作用
    自動化養殖設備、新的飼養工藝
        遺傳進展的加快是主要原因
        最近十年,遺傳進展加快的主要原因是選擇準確性和選擇強度的提高

        性能測定技術的發展也使測定的準確性提高

        BLUP遺傳評估技術可以利用所有相關資料,隨著時間的推移和資料積累,準確性不斷提高


        以下分子中有一項為零,進展就是零

遺傳發展=        選擇強度×遺傳變異×選擇準確性/世代間隔

        
        一個高效的場內遺傳改良計畫是整個育種體系的基礎
            首先需要建立一個育種核心群,理論上規模越大越好
        要有完善、準確的性能測定,及時的遺傳評估

        科學合理的育種核心群選留、淘汰制度。
        需要在影響遺傳進展的四因素之間做出最優選擇
        我們國家許多種豬場的育種群也實行每年33%的淘汰,母豬胎次分佈均勻。這種育種體系平均世代間隔接近2年,年遺傳進展緩慢。
        遺傳進展是可以累積的,世代間隔短才能實現更快的積累。

        育種核心群的規模受到豬場規模、測定能力、種豬銷售、經濟等方面的限制。
        擁有規模比較大的擴繁場則可以相對大一些。
        規模一般的可以純種群基礎上建立育種核心群,將純種母豬劃分為育種群、繁殖群。

    核心群最低要求:長白、大白豬的母豬數量不低於300頭,杜洛克不低於100頭。

        如:我們組建了300頭基礎母豬的核心群,每個月產50窩,每窩選取最好的1公、2母測定。平均每個月測定150頭(50頭公豬、100頭母豬)

        每週測定結束以後,將所有核心群的豬和新測定的豬進行遺傳評估,計算選擇指數。
        根據指數大小對所有測定個體和目前仍在育種群的個體進行排隊,根據指數大小和體型決定選留那些後備豬、淘汰那些後備豬和目前在育種 群指數比較低的個體。

        如果測定的100頭母豬中有30頭好于現有育種群300頭母豬的後30名。就淘汰原群體的後30頭。
        淘汰的個體進入繁殖群或擴繁場
        任何時候,只要有新測定後備豬的指數好于現有群體,就進行淘汰、補充。
        由於公豬的選擇強度高,會不斷出現新的優秀公豬,淘汰的公豬進入擴繁場、生產場(這2個層次場的公豬應全部來源於育種核心群
        一般使用1月份測定結束的公豬,給3月份測定結束的母豬配種
        但公豬的淘汰、選擇還需要考慮血緣問題。
        無論如何,要儘量縮短公豬的利用時間
        如果有600頭基礎母豬的純種群,可以將其劃分為300頭核心群、300頭繁殖群。
        如果豬場本身還有比較大的擴繁場,則可以增加核心群數量,如400或500
        以上的幾條是相互聯繫的,不能只考慮一個方面,如為了增加選擇差,在第一胎母豬的後代中,可供選擇的個體數量不夠時,就需要從第二、三胎母豬中選擇,這就增加了世代間隔;但不從第二、三胎母豬中選擇,雖縮短了世代間隔,卻降低了選擇強度。這就需要全面考慮,找出一個最佳的方案。
只使用後備公豬的情況下:
   
      第一胎留種世代間隔:1.08年
    第二胎:1.29年
    第三胎:1.5年
    第六胎:2.12年

  第二胎母豬後代要比後備豬後代的指數高20%(1.29/1.08),至少15%才可以留種,

場內遺傳評估―        完善的系譜文件對遺傳評估的準確性非常重要
―        BLUP遺傳評估可以校正許多環境影響因素
―        遺傳評估的及時性
―        遺傳評估要利用所有可利用的資料

核心群的開放與閉鎖
         上世紀九十年代以前,國內種豬的育種都是採用閉鎖群繼代選育
        閉鎖群選育早期有較大的進展,而以後卻越來越緩慢
        育種理念發生了一些變化,逐漸從重視純種選育、血統轉變為重視生產性能、雜交
        開放核心群育種方案擴大了核心群選擇的範圍,加快了遺傳進展,同時還增加了核心群的有效群體含量
        國內種豬場往往會偏重開放,即通過不斷引種雜交來取得遺傳進展。這樣的結果是大量優良基因並非純合,不能穩定遺傳,幾年之後不得不重新引種
        當種豬群的遺傳素質不高時,就應該以開放為主。但是,當豬群已經具有了很優秀的基因時,就應以閉鎖為主。
        能通過閉鎖選育解決的,儘量少開放,降低疫病風險。

       
近交的控制
       
在制定選配計畫時,大部分育種公司對於近交的控制過於簡單,避免血緣相近的個體之間的交配
        這種方法是以假定基因尤其是有害基因在血緣較遠的個體間是分離的為前提的
        近交衰退主要發生於一些與適應性相關的性狀上
        某些性狀可能並不會出現近交衰退現象
        近交可以揭露和消除有害基因,增大基因頻率,促進基因的純合,使優良性狀的遺傳更穩定,提高畜群的同質性,保持優良個體的血統。對於育種核心群來說,適度近交是可行的,也是必要的。
       
聯合育種與場內遺傳改良
        1987年,英國Cotswold豬發展公司就提出並應用了多組核心群(group nucleus)育種結構,實際是豬的聯合育種的開始。
        聯合育種不等於所有的育種場只測定規定的3個性狀
        在包含這3個基本性狀的基礎上,可以根據企業自己的實際情況,增加測定性狀
        國外豬育種成功的主要一點是能夠根據生產性能、市場的變化,選育目標及時做出調整。
    如丹麥:1992年開始重點選擇產仔數→5日齡活仔數,公豬的選擇增加屠宰損耗、肉質
    目前一些公司針對產仔數提高,開始選擇斷奶窩重、母豬哺乳期採食量

        聯合育種也不是所有的場應用同一個選擇指數,在選擇指數的制定上,許多企業只會應用軟體提供的選擇指數,沒有根據自己豬群的情況、育種進展的變化情況做出調整。
        這些選擇指數有的可能以應用十年以上。
        除國家聯合評估的指數外,企業應該有自己的選擇指數。
        我國大部分種豬企業的育種方案還有很大的優化餘地。
        育種專家或技術人員的責任就是在選擇強度、遺傳變異、選擇準確性和世代間隔這四因素之間找到最佳的平衡點。
        1個豬場獨立育種是很難取得明顯進展,除非規模非常大。
        種質的引進與交流對取得遺傳進展非常關鍵。育種是一全球性的行業
        但只引進、選育不夠也無法成為一個優秀的種豬企業。

希望我們的種豬企業注重育種方案的優化,提高育種效率,儘快縮短與國外的差距。


王立賢
中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
100193 北京市海澱區圓明園西路2號
電話:010-62816011
E-mail:iaswlx@263.net
13910768536


PS. 原始檔案下載:(此段為園長所編輯):

场内高效遗传改良计划的建立与联合育种  王立贤

評分

參與人數 1金錢 +10
收起 理由
taiwanp + 10 很給力!
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發表於 2011-12-23 15:16:25 | 顯示全部樓層
內地的畜產科學的步伐,
進步之快,有目共睹。

簡直是用跳的,
理由,,,利之所趨嘛!!

但,就怕類似動車事件重演!!
總帖子數排名︰5

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發表於 2011-12-23 15:55:15 | 顯示全部樓層
本帖最後由 蘇少儀 於 2011-12-23 15:56 編輯

BLUP是要和大家來比,自己做,不過是電腦紀錄罷了
看看,聽聽就好
可別當真...............................
多讀,多寫,文章就可以寫得好,事不一定做得出來

在台灣,這種業務要產業組織做
要產業組織做的事,大家就是驅力
大家加油
總帖子數排名︰4

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發表於 2011-12-23 18:49:37 | 顯示全部樓層
BLUP = Best Linear Unbiased Prediction
每一個字都有一大串的統計理論與實際操作在後面撐著
這是一個非常有用的遺傳評估工具,前提是有沒有人收集準確的測定資料,
例如:某些階段之體重、頭數、脂肪厚度、腰眼面積及豬隻完整系譜等等
如果有此前提,則BLUP的功效會很顯著,二十年來我曾為美國、日本、泰國
哥斯達黎加、甚至台灣的幾個夠規模的種豬群做過這種計算分析,也提供
他們許多的育種選種策略,可是就等不到台灣的眾多種豬場之間的聯合,
十多年來(從pighead回台之後)我不知道在多少場合(公開、私下)呼籲產官學
界一起來努力準確收集資料加以整合,一起計算分析出種豬群的育種價,
讓各性狀的選育可以更精準,只可惜到如今只聞樓梯響....
對岸從2009年起的十二年百大核心種豬計畫就是如此的聯合育種工作,
姑且不論其是否可以成就甚麼未來,總是有個努力起頭,至少可以去經歷
歐美曾走過的那條路,如果真的能夠做出來,
呵呵呵,我們在台灣的種豬場或肉豬場未來就得要去對岸買種豬了

不過話說回來,文中提及:每窩選取最好的1公、2母測定 ---> 樣本數不足
這會讓上面講的前提不足夠,如此評估的育種價會有較大的誤差值,這樣就
失去BLUP遺傳評估的準確性

總的來說,BLUP四個字寫起來簡單,做起來不是那麼容易,但是卻挺有效的
而且有了這個BLUP的制度長期做下來,才會有足夠的資料進行有效的基因選拔,
現在在台灣所謂的基因選拔實在是沒有甚麼真正穩固的基礎(或說依據)可言
如今,歐美已在其長期BLUP分析資料中逐步建立下一個世代的選拔工具
叫做Genomic selection (基因體選拔),可能乳牛會跑第一

點評

真的參與BLUP的場數愈多價值愈高 這是老外用軟體教育業者合作 講合作,要大家把自場的資料拿出來,最重要的信任度 但是任何一個好的制度在臺灣就有業者想辦法弄得污鴉鴉 為什麼弄得污鴉鴉,清水無魚................  詳情 回復 發表於 2011-12-23 21:55
總帖子數排名︰33

升級   53.05%

發表於 2011-12-23 19:02:06 | 顯示全部樓層
這些要有錢才能作,沒錢,再會都沒用!!
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升級   72.4%

發表於 2011-12-23 19:29:30 | 顯示全部樓層
養豬好像不用那麼麻煩
進口國外那些top 5%有epd或 ebv的冷凍精液
每年配個幾胎應該夠了

點評

冷凍精液的效果 沒想像中那麼好的. 尤其在發展精肉型type的台灣..  詳情 回復 發表於 2011-12-23 20:15
總帖子數排名︰9

升級   62.25%

發表於 2011-12-23 20:15:50 | 顯示全部樓層
小甜甜 發表於 2011-12-23 19:29
養豬好像不用那麼麻煩
進口國外那些top 5%有epd或 ebv的冷凍精液
每年配個幾胎應該夠了

冷凍精液的效果
沒想像中那麼好的.

尤其在發展精肉型type的台灣..
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升級   0%

發表於 2011-12-23 21:55:16 | 顯示全部樓層
本帖最後由 蘇少儀 於 2011-12-23 22:05 編輯
pighead 發表於 2011-12-23 18:49
BLUP = Best Linear Unbiased Prediction
每一個字都有一大串的統計理論與實際操作在後面撐著
這是一個非常 ...


真的參與BLUP的場數愈多價值愈高
這是老外用軟體教育業者合作
講合作,要大家把自場的資料拿出來,最重要的信任度
但是任何一個好的制度在臺灣就有業者想辦法弄得污鴉鴉
為什麼弄得污鴉鴉,清水無魚...................或跟不上,乾脆砸了
再則BLUP做起來,種豬場的價值,所需要種豬場的家數及進口種豬的數量............
這些都是錢................

說句實話,種豬育種工作在過去有一些工作人員並不適任,因為他們在養豬戶的心中對他們已不存信任
利益的糾葛,資料的誤用

如果有人想把這一塊做起來,建立畜主的信任才有金字招牌(電腦系統如何保密,資料不外泄,工作人員素質.................)
這種工作的工作量,人工成本及半途而廢的風險............是不是從有興趣的一貫豬場做起,由班而社而................
從上而下的阻力大,就由下而上,逐步滙流
這種服務,如果無法由公部門取得就收費(收費就一定要讓業者有看得到的利益)
不需要全場做,逐步完善即可
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發表於 2011-12-23 23:27:19 | 顯示全部樓層
紀錄的蒐集需要花時間    以及強大的毅力
不然都會想   算了吧
總帖子數排名︰5

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發表於 2011-12-24 05:11:23 | 顯示全部樓層
好像天下的便宜事花錢就有..................
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